Ученые создали пангеном и панфеном баклажана для выведения новых сортов

Международная группа исследователей, включая специалистов из INRAE, опубликовала полный набор генов (пангеном) и агрономических характеристик (панфеном) баклажана. Эта работа охватывает все известные генетические вариации вида, включая гены, отвечающие за такие признаки как образование колючек.

Различные сорта баклажанов. Автор: Laura Toppino—CREA, Монтаназо-Ломбардо, Италия

Исследование основано на анализе более 3400 культурных и диких разновидностей баклажана. Ученые идентифицировали свыше 20 000 семейств генов и 218 агрономических признаков, включая устойчивость к фузариозному увяданию и антиоксидантную способность. Полученные данные находятся в свободном доступе и представляют ценность для селекционеров, работающих над созданием сортов, адаптированных к местным условиям и изменению климата. Результаты опубликованы в журнале Nature Communications.

Пангеном представляет собой полный репертуар генов вида, включая все возможные вариации между особями. У культурных растений, таких как баклажан, эти вариации являются результатом тысяч лет человеческой селекции.

40 референсных геномов баклажана. Автор: Nature Communications (2025)

Полевые исследования для характеристики генов и агрономических признаков

Команда изучила 368 сортов баклажана, представляющих глобальное разнообразие вида, а также двух его диких предков. Исследователи секвенировали геном каждой разновидности и изучили 218 агрономических признаков в полевых условиях, включая устойчивость к засухе, болезням и состав плодов.

Полевые испытания проводились в Валенсии (Испания), Монтаназо-Ломбардо (Италия) и Анталье (Турция) — регионах с разными климатическими условиями и специфическими методами возделывания. Анализ показал, что геном баклажана содержит 16 300 «основных» семейств генов (присутствуют во всех сортах) и 4 000 «опциональных» (присутствуют только в определенных сортах).

Исследование выявило более 3000 ассоциаций между агрономическими признаками и генами. В данной публикации команда сосредоточилась на трех ключевых характеристиках:

• Устойчивость к фузариозному увяданию
• Содержание изохлорогеновой кислоты (антиоксиданты, связанные с горечью и потемнением мякоти)
• Образование колючек

Остальные 215 признаков будут опубликованы в будущих работах. При глобальном производстве баклажанов около 60 миллионов тонн в год, публикация полной коллекции генов и агрономических характеристик этой культуры представляет собой важный шаг вперед для селекции.