ИИ-инструмент ProRNA3D-single ускорит разработку лекарств, визуализируя молекулярные взаимодействия

3D-изображение вирусной РНК, взаимодействующей с белком хозяина, созданное инструментом ProRNA3D-single. Автор: Virginia Tech

Учёные из Виргинского технологического университета представили открытый ИИ-инструмент ProRNA3D-single, который значительно точнее предсказывает и визуализирует трёхмерные структуры взаимодействия РНК и белков. Это открывает новые возможности для ускоренной разработки лекарств против вирусов и нейродегенеративных заболеваний, таких как болезнь Альцгеймера.

Инструмент, описанный в журнале Cell Systems, объединяет две большие языковые модели — для белков и для РНК — позволяя им «общаться» друг с другом. В результате система генерирует детальные 3D-модели молекулярных комплексов.

«Конечная цель — ускорить процесс открытия лекарств, чтобы предотвратить взаимодействие РНК-вирусов с белками хозяина, потенциально останавливая инфекции до того, как они перерастут в пандемии, или подавляя нарушенную функцию РНК-связывающих белков при болезни Альцгеймера», — пояснил руководитель исследования Дебсвапна Бхаттачарья.

Метод, над которым работали два года, является универсальным и не привязан к конкретным типам вирусов. Разработка с открытым исходным кодом уже доступна на GitHub. Учёные надеются, что их работа поможет исследователям во всём мире быстрее находить мишени для лекарственной терапии и создавать новые препараты.