Открыты геномы 24 000 неизвестных микробов, включая новые ветви жизни
Исследователи из Технологического университета Квинсленда восстановили геномы более 24 000 ранее неизвестных видов микробов, включая представителей совершенно новых ветвей жизни, которые, вероятно, эволюционировали до появления растений и животных. Результаты опубликованы в журналах Nature Biotechnology и Nature Methods.
Доцент Бен Вудкрофт объяснил, что микробные сообщества играют жизненно важную роль в поддержании всей жизни на Земле. «Мы знаем, что микробы кишечника необходимы для пищеварения и здоровья, но микробы не менее важны и в окружающей среде — от поддержки роста растений в почвах до производства кислорода в океанах», — отметил он.
Ключевым инструментом поиска стала метагеномика — метод извлечения данных ДНК непосредственно из образцов окружающей среды. Для обработки этих данных учёные разработали два программных инструмента.
Первый инструмент, SingleM, быстро сканирует образец и идентифицирует присутствующие организмы, включая виды, кардинально отличающиеся от известных. Анализ более 700 000 наборов данных показал, что около 75% клеток в экологических образцах принадлежат неизвестным видам.
Второй инструмент, Bin Chicken, названный в честь австралийского ибиса, который роется в мусорных баках, «роется» в метагеномных данных для восстановления полных геномов. С его помощью было реконструировано 24 000 новых микробных геномов.
«Эти линии, вероятно, эволюционировали до растений и животных и помогают нам лучше понять раннюю эволюцию жизни», — заявил ведущий автор исследования доктор Сэм Арони.
Открытие имеет значение для изучения изменения климата, поскольку микроорганизмы являются крупнейшими производителями метана на Земле. Новые геномы уже интегрируются в климатические модели и эволюционные исследования.
0 комментариев