«Прыгающие гены» термитов помогли построить древо жизни
Ученые из Окинавского института науки и технологий разработали новый метод построения филогенетического древа, основанный на анализе транспозонов — так называемых «прыгающих генов». Исследование, опубликованное в журнале Current Biology, на примере термитов демонстрирует, как этот подход позволяет разрешать сложные эволюционные загадки, включая периоды быстрой диверсификации видов.
«Филогенетические деревья, которые отображают отношения между различными организмами, имеют ключевое значение для эволюционной биологии. Они помогают нам понять истоки современного биоразнообразия», — поясняет профессор Томас Бургиньон, руководитель исследования.
Транспозоны — это мобильные генетические элементы, способные перемещаться по геному и вызывать мутации. Несмотря на то, что они составляют до 50% человеческого генома, до недавнего времени их редко использовали для построения древа жизни из-за сложностей в анализе.
Команда секвенировала геномы 45 видов термитов и двух видов тараканов, идентифицировав почти 38 000 семейств транспозонов. Анализируя их присутствие и отсутствие у разных видов, ученые смогли построить эволюционное древо, точность которого сопоставима с деревьями, построенными на основе тысяч белковых маркеров.
Метод особенно перспективен для работы с фрагментированной ДНК, например, из музейных коллекций, поскольку транспозоны представляют собой короткие последовательности, которые можно обнаружить даже в сильно деградировавших образцах.
Исследователи надеются, что их подход вдохновит других ученых на использование транспозонов для прояснения давних эволюционных загадок не только среди насекомых, но и в других ветвях животного царства.
0 комментариев