Учёные впервые составили детальную карту кишечных бактерий лемура индри и обнаружили 47 новых видов

Фото индри в тропическом лесу Мадагаскара. Автор: Филиппо Каругати

Совместное исследование впервые определило состав кишечного микробиома индри — лемура, находящегося на грани исчезновения и обитающего только на северо-востоке Мадагаскара. Исследование провели учёные из Департамента медицины и наук о жизни (MELIS) Университета Помпеу Фабра и Университета Тренто (Италия).

Помимо выявления 47 ранее неизвестных видов бактерий, исследование показало, что микробиом индри передаётся внутри их социальной группы. Это может иметь значение для сохранения их среды обитания.

Индри (Indri indri), или бабакото на местном языке, — древесный лемур, эндемик Мадагаскара, обитающий в тропических лесах северо-востока острова. Он питается листьями, фруктами, семенами, цветами, корой и иногда почвой. Согласно Красному списку Международного союза охраны природы (МСОП), индри находится в критической опасности из-за потери среды обитания в результате изменения климата и деятельности человека.

Индри живут небольшими семьями — стабильными социальными группами — от двух до пяти особей. Они моногамны и образуют долгосрочные связи в матриархальном обществе. Взаимодействие между особями из разных групп минимально, так как каждая группа занимает чётко обозначенную территорию. Кроме того, этот вид никогда не удавалось содержать в неволе.

Исследование, опубликованное в журнале The ISME Journal, проанализировало микробиом образцов фекалий и почвы из регионов, где обитают шесть семей индри. Собрав геномы, исследовательская команда идентифицировала 48 видов бактерий, составляющих микробиом индри. Почти все секвенированные виды (47) ранее не были описаны и являются уникальными для этих лемуров.

«Единственный известный вид, который мы обнаружили, — это E.coli, и он в основном встречается у популяций индри, живущих ближе к районам, часто посещаемым людьми», — объясняет Мирейя Вальес Коломер, исследователь MELIS-UPF, руководившая исследованием.

«Мы обнаружили, что подавляющее большинство бактериальных видов в микробиоме индри — новые и специфичны для этих лемуров. Поэтому, если индри вымрут, исчезнут и бактерии, составляющие их микробиоту», — подчёркивает Вальес Коломер.

Кроме того, исследователи установили, что микробиом передаётся между индри одной социальной группы и что они не получают никаких видов бактерий из почвы, несмотря на её употребление.

«У всех индри одни и те же виды бактерий, но штаммы бактерий различаются от одной социальной группы к другой. Каждая "семья" имеет уникальные бактериальные штаммы, и генетическое расстояние между штаммами коррелирует с расстоянием между популяциями лемуров, живущих изолированно друг от друга», — отмечает Никола Сегата из Университета Тренто, соавтор исследования.

Хотя это предварительное исследование (из-за небольшого размера выборки), «мы надеемся, что описание микробиома индри станет ещё одним инструментом для сохранения его всё более фрагментированной среды обитания и поможет предотвратить вымирание вида», — заключает Сегата.

Дополнительная информация: Франциска Лабиса-Мораис и др., Bacterial transmission within social groups shapes the underexplored gut microbiome in the lemur Indri indri, The ISME Journal (2025). DOI: 10.1093/ismejo/wraf136

Источник: Universitat Pompeu Fabra - Barcelona