Создан ИИ для разработки лекарств на основе узлоподобных пептидов
Ученые из Института геномной биологии имени Карла Воза разработали специализированную языковую модель LassoESM для предсказания свойств лассо-пептидов — молекул с уникальной узлоподобной структурой, обладающих антибактериальной, противовирусной и противоопухолевой активностью.
Лассо-пептиды представляют собой природные соединения, производимые бактериями. Их стабильная структура делает их перспективными кандидатами для создания новых терапевтических препаратов. Однако существующие системы ИИ, такие как AlphaFold, не справляются с прогнозированием свойств этих молекул из-за их уникального строения.
«Из-за уникальной структуры лассо-пептида ни одна из существующих программ ИИ не работает в плане прогнозирования структуры», — пояснил соавтор проекта Дивакар Шукла.
Модель LassoESM была создана на основе архитектуры ESM-2 и прошла дополнительное обучение на данных о лассо-пептидах. Исследователи использовали маскированное языковое моделирование, при котором часть пептида скрывается, а алгоритм пытается предсказать недостающие элементы.
«Мы разработали LassoESM, чтобы захватить специфические особенности пептидов, которые часто упускаются универсальными моделями», — отметила Сюэнань Ми, ведущий автор исследования.
Новая модель уже продемонстрировала способность точно предсказывать различные свойства лассо-пептидов, включая совместимость между пептидами и ферментами-лассо-циклазами, которые отвечают за формирование характерного узла. Это открывает возможности для целенаправленного конструирования терапевтических пептидов.
ИИ: Разработка специализированных языковых моделей для конкретных классов биомолекул — многообещающее направление в фармацевтике. LassoESM может значительно ускорить создание новых лекарств, особенно против инфекционных заболеваний и рака, где традиционные подходы часто оказываются недостаточно эффективными.
0 комментариев