Новый метод изучения биомолекул, ослабляющих иммунный ответ при раке

Графическая иллюстрация. Автор: Journal of the American Chemical Society (2025). DOI: 10.1021/jacs.5c07631

Некоторые биохимические процессы могут ухудшать способность иммунной системы распознавать и уничтожать раковые клетки. Команда учёных из Университета Пердью под руководством Энди Тао разработала новый метод изучения этих процессов. Эффективность метода была подтверждена в экспериментах с клеточными линиями лейкемии и редкого типа рака печени.

Тао и 10 соавторов опубликовали детали нового метода в Journal of the American Chemical Society. Их работа позволяет отслеживать и идентифицировать различные типы белков, а также малоизученный, но широко распространённый класс биологических частиц — внеклеточные везикулы (EV), которые могут снижать эффективность иммунотерапии.

EV переносят различные молекулы между клетками, включая рибонуклеиновую кислоту (РНК), которая играет ключевую роль в клеточных и вирусных процессах, таких как синтез белка. Новый метод основан на изучении как РНК-связывающих белков, так и EV, которые, по данным исследований, связаны с развитием многих типов рака.

«РНК-связывающие белки крайне важны, поскольку именно белки выполняют основную работу в клетках», — пояснил Тао, профессор биохимии и член Института исследования рака Пердью.

Метод позволяет определить, какие именно РНК-связывающие белки, переносимые EV, влияют на иммунные клетки. Особый интерес представляют EV, выделяемые опухолями — они переносят РНК, способные изменять иммунный ответ, взаимодействуя с белками в клетках-реципиентах.

Новый подход решает проблему низкой пропускной способности существующих методов. Он включает мечение РНК синтетической органической молекулой, реагирующей на ультрафиолетовый свет. Под воздействием УФ-излучения происходит сшивка (химическое соединение) близлежащих белков.

«Меченые РНК доставляются в иммунные клетки через EV, после чего мы используем УФ для сшивки белков в клетке-реципиенте», — объяснил Тао.

Метод был успешно протестирован на клеточной линии Jurkat (используемой для изучения лейкемии) и клетках внутрипечёночной холангиокарциномы — редкого типа рака печени, устойчивого к иммунотерапии.

Иммунотерапия основана на способности иммунной системы распознавать и уничтожать раковые клетки. Однако этот процесс может нарушаться, в том числе из-за воздействия EV. Дальнейшие исследования помогут понять, как именно EV влияют на иммунные клетки.

«Роль EV становится всё более очевидной», — отметил Тао.

Дополнительная информация: Zheng Zhang et al, Proteomic Tracking Extracellular Vesicle RNA Interactors in Recipient Immune Cells through Orthogonal Labelings, Journal of the American Chemical Society (2025). DOI: 10.1021/jacs.5c07631