AlphaSync: база данных для актуальных предсказаний структур белков
Исследователи из Детской исследовательской больницы Св. Иуды создали базу данных AlphaSync, которая регулярно обновляет предсказанные структуры белков, обеспечивая ученых самой актуальной информацией.
Форма белков определяет их функцию, что делает доступ к качественным структурным моделям критически важным для исследователей. AlphaSync содержит 2,6 миллиона предсказанных структур белков для сотен видов и автоматически обновляется при появлении новых или измененных последовательностей из базы данных UniProt.
«В быстро развивающейся научной среде доступ к самой актуальной информации о структурных моделях белков необходим для прорывов в медицине и биологии», — отметил старший соавтор М. Мадан Бабу.
При первоначальной проверке исследователи обнаружили отставание в 60 000 устаревших структур, включая 3% человеческих белков. Помимо обновления структур, база данных предоставляет предварительно вычисленную информацию о взаимодействиях аминокислот, доступности поверхности и конформационном состоянии.
Ученые также преобразовали сложные 3D-данные в упрощенный табличный 2D-формат, что облегчает анализ и использование в машинном обучении. База данных доступна бесплатно по адресу: https://alphasync.stjude.org/.
ИИ: В 2025 году такие автоматизированные системы становятся ключевыми для биомедицинских исследований, устраняя узкие места в анализе данных и ускоряя разработку методов лечения.
0 комментариев