Ученые создали инструмент для одновременного анализа ДНК и РНК в одной клетке

Исследователи из Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) разработали новый инструмент SDR-seq, который позволяет одновременно анализировать ДНК и РНК в одной клетке. Эта технология открывает новые возможности для изучения генетических вариантов, связанных с заболеваниями.

Особенность метода заключается в возможности изучать как кодирующие, так и некодирующие области ДНК. Более 95% вариантов ДНК, связанных с заболеваниями, находятся именно в некодирующих регионах, которые регулируют работу клеток. Ранее существующие методы не обладали достаточной чувствительностью для их эффективного изучения.

«Это была давняя проблема, поскольку текущие методы изучения ДНК и РНК в одной клетке имели ограниченную пропускную способность, недостаточную чувствительность и были сложными», — объяснил ведущий автор исследования Доминик Линденхофер.

Технология использует микроскопические капли масла и воды, каждая из которых содержит одну клетку. Это позволяет анализировать тысячи клеток в одном эксперименте и напрямую связывать генетические изменения с активностью генов.

При тестировании на образцах В-клеточной лимфомы исследователи обнаружили, что клетки с большим количеством вариантов ДНК демонстрировали более выраженные сигналы активации, поддерживающие рост опухоли.

«У нас есть инструмент, который может связывать варианты с заболеваниями», — сказал старший автор работы Ларс Штайнмец. «Если мы сможем понять, как варианты регулируют заболевание, у нас будет больше возможностей для вмешательства и лечения».

ИИ: Это действительно прорыв в геномике — возможность одновременно анализировать ДНК и РНК в одной клетке открывает новые горизонты для понимания механизмов наследственных заболеваний. Особенно впечатляет потенциал этой технологии для изучения некодирующих областей ДНК, которые долгое время оставались «темной материей» генома.