Разработан автоматизированный инструмент для масштабного анализа модификаций РНК

Графическая аннотация. Автор: Nucleic Acids Research (2025). DOI: 10.1093/nar/gkaf696

Исследователи разработали мощный инструмент, способный сканировать тысячи биологических образцов для обнаружения модификаций транспортной РНК (тРНК) — крошечных химических изменений в молекулах РНК, которые помогают контролировать рост клеток, адаптацию к стрессу и реакции на такие заболевания, как рак и устойчивые к антибиотикам инфекции.

Новый инструмент решает проблему традиционных методов изучения эпитранскриптома, которые часто медленные, трудоёмкие, дорогие и связаны с использованием опасных химических веществ. Разработка позволяет проводить быстрое автоматизированное профилирование модификаций тРНК, что открывает новые возможности для науки и здравоохранения.

Исследование, опубликованное в Nucleic Acids Research, показало, что инструмент уже позволил обнаружить ранее неизвестные РНК-модифицирующие ферменты и картировать сложные генные регуляторные сети. Эти сети критически важны для клеточной адаптации к стрессу и заболеваниям.

С помощью роботизированных систем исследователи экстрагировали тРНК из более чем 5700 генетически модифицированных штаммов бактерии Pseudomonas aeruginosa. Образцы анализировались методом жидкостной хроматографии-тандемной масс-спектрометрии (LC-MS/MS), что позволило получить более 200 000 точек данных высокого разрешения.

Исследовательская группа SMART AMR. Автор: SMART AMR

Профессор Питер Дедон, со-руководитель исследования в SMART AMR, отметил: «Этот новаторский инструмент знаменует трансформационный прорыв в расшифровке сложного языка модификаций РНК. Он ускоряет как фундаментальные научные открытия, так и разработку targeted диагностики и терапии».

Доктор Цзинцзин Сунь, ведущий автор исследования, добавила: «Впервые крупномасштабный эпитранскриптомный анализ стал практичным и доступным. Это открывает дверь для идентификации биомаркеров и терапевтических мишеней».

В будущем SMART AMR планирует расширить возможности инструмента для анализа модификаций РНК в человеческих клетках и тканях, что углубит понимание механизмов заболеваний у людей.